Μαζί με το αεροδρόμιο και την ακτοπλοΐα, η Σητεία ετοιμάζεται να υποδεχτεί και τα υδροπλάνα, με το νομό Λασιθίου να αποκτάει πλέον πολλαπλές μεταφορικές δυνατότητες.
Οπως αναφέρει η εταιρεία Hellenic Seaplanes αυτό ενισχύεται και από το ήδη εγκεκριμένο υδάτινο πεδίο στο λιμάνι της Σητείας που επιτρέπει 6 ζεύγη πτήσεων την ημέρα με υδροπλάνα.
Η χωροθέτηση των θαλασσοδιαδρόμων στη Σητεία επιτρέπει τη διασύνδεση με άλλες εγκαταστάσεις, μεταξύ άλλων την Ιεράπετρα και την Κίσσαμο ενώ αναμένεται να αυξηθεί η κινητικότητα για island hopping δρομολόγια στo Νότιο Αιγαίο και συγκεκριμένα προς τις υποδομές σε Δωδεκάνησα και άλλους προορισμούς των Κυκλάδων με την ολοκλήρωση της κατασκευής και πιστοποίησης λειτουργίας του υδατοδρομίου της Σητείας.
